花椒果皮基因组DNA提取:不同试剂盒性能评估与比较研究

作者：易秋菊; 邢冉冉; 张九凯; 葛毅强; 陈颖^*

来源：食品安全质量检测学报, 2023, 14(22): 134-142.

DOI：10.19812/j.cnki.jfsq11-5956/ts.2023.22.027

• 花椒
• 果皮
• DNA提取试剂盒
• 简单加权分析

目的 通过比较不同植物试剂盒在花椒果皮DNA提取中的差异,探究适用于花椒果皮的基于离心柱法的DNA提取试剂盒。方法 选取8种不同品种的花椒,利用TIANGEN DNAsecure新型植物基因组DNA提取试剂盒(Tiangen-Ⅰ)、DNeasy Plant Mini kit (DNeasy)、多糖多酚植物基因组DNA提取试剂盒(Tiangen-Ⅱ)、Nucleospin?Food kit (Nucleospin) 4种基于离心柱法的试剂盒提取花椒果皮基因组DNA,通过对比提取到的DNA浓度、纯度、聚合酶链式反应扩增能力,以及提取过程中的成本、耗时等因素,基于简单加权(simple additive weighting, SAW)分析对比不同试剂盒对于花椒果皮DNA的提取效果,并进行综合评分。结果 不同试剂盒各有优缺点,最终Tiangen-Ⅰ试剂盒得分1.64,排名第一,综合考虑价格、所用时间与提取得到的DNA质量,Tiangen-Ⅰ试剂盒是更适用于花椒果皮DNA提取的试剂盒;同时,Nucleospin试剂盒在提取得到的花椒DNA质量方面有着较好的表现。结论 本研究以花椒为例探究干扰组分较多植物的基因组DNA试剂盒提取方案,通过比较Tiangen-Ⅰ试剂盒被推荐作为最佳选择,本研究为花椒果皮及其他相似植物的基因组DNA提取提供了参考方案。

• 单位
  中国检验检疫科学研究院; 中国农村技术开发中心; 中国农业大学