先导化物的发现是新药研发流程中首要环节。基于靶点结构的药物设计在先导化物的发现过程中具有十分重要的作用和地位。在靶点三维结构缺乏的情况下,用计算机模拟的方法来预测是获得其结构的一条重要渠道。同源建模是应用最为广泛的蛋白质三维结构模拟方法,而蛋白质序列比对是同源建模中的关键一环。对蛋白质的序列比对、比对结果评价、比对结果优化等内容进行论述,并对相关方面的最新进展作介绍。
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