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摘要
为了分析高、低剩余采食量(residual feed intake, RFI)相关肉牛下丘脑组织中的基因表达图谱，探讨差异表达基因与牛RFI表型变异间的关系，试验选择高剩余采食量(HRFI)、低剩余采食量(LRFI)秦川牛各3头，分为HRFI组和LRFI组，采集下丘脑组织样本，从中提取总RNA进行转录组测序，筛选出RFI相关差异表达基因，对这些基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析，并利用STRING数据库构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络图，最后随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。结果表明：HRFI组和LRFI组中均存在1 538个差异表达基因，包括AGRP、PMCH等与采食相关的基因，GH1、MTNR1A和RYR2等与代谢相关的基因，此外差异基因主要富集于钙信号通路、cAMP信号通路和昼夜节律等通路中。通过蛋白质相互作用网络筛选出3个核心子网络和7个核心基因。实时荧光定量PCR验证结果与转录组测序结果一致。说明下丘脑组织中AGRP、PMCH、GH1、MTNR1A和RYR2等差异表达基因及钙信号通路、cAMP信号通路和昼夜节律等多条通路可能参与调控肉牛RFI。
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