深圳H7N9流感病毒PB1-F2基因分子特征

作者:董方圆; 王昕; 彭博; 武伟华; 刘慧; 丁小满; 郑青; 房师松
来源:中华实验和临床病毒学杂志, 2015, 29(06): 493-497.
DOI:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2015.06.007

摘要

目的了解深圳20株H7N9流感病毒PB1-F2基因的分子特征。方法使用DNAstar、MEGA等生物软件对深圳地区H7N9流感病毒PB1-F2进行核苷酸、氨基酸序列同源性和系统进化分析。结果 2014年底到2015年H7N9流感病毒爆发主要集中在广东省,以深圳居首。深圳20株H7N9流感病毒PB1-F2基因主要分为三个亚系。3株的PB1-F2基因的N端缺失编码52个氨基酸;1株PB1-F2基因的C端缺失编码57个氨基酸;1株PB1-F2基因的C端缺编码76个氨基酸;其余株PB1-F2基因编码90个氨基酸。各深圳株与A/Anhui/1-DEWH730/2013株相比核苷酸和氨基酸的同源性分别为96.0%100%和89.0%100%。各深圳株之间的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为94.9%100%和85.7%100%。结论深圳H7N9流感病毒PB1-F2基因具有独特的分子特征。

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