北京市一例HIV-1独特型重组毒株近全长基因组特征分析

作者：高占^*; 陈立; 刘正敏; 孙婧

来源：国际病毒学杂志, 2022, 29(06).

• 人类免疫缺陷病毒1型
• 近全长基因序列分析
• 重组毒株
• 献血人群

目的分析北京市献血人群筛查中发现的1例HIV-1独特型重组毒株的基因结构和重组特点。方法基于2018年北京市血液筛查时发现的1例HIV核酸阳性抗体阴性的样本, 提取病毒RNA并逆转录为cDNA, 用近末端稀释法分两段扩增病毒近全长基因组并测定序列。运用RIP、jpHMM和SimPlot3.5软件进行重组分析, 同时采用MEGA7软件构建Neighbor-joining系统进化树对该毒株的同源关系进行分析。结果共获得长度为8 792 bp的HIV-1近全长基因序列, 分析表明该序列由CRF01AE和CRF07BC重组片段组成。与Los Alamos HIV Database (www.hiv.lanl.gov/content/index)中收录的全长序列相比该毒株具有3个独特的重组断点, 分4个重组片段, 分别是ICRF01AE(790～6035, HXB2), IICRF07BC(6036～8586, HXB2), IIICRF01AE(8587～8828, HXB2)和IVCRF07BC(8829～9411, HXB2)。其中ICRF01AE区域属于CRF01AE的C4簇;IICRF07BC区域属于CRF07BC的CRF07BCN簇。结论 1例参与献血的HIV核酸阳性而抗体阴性的感染者携带的毒株具有新型独特的重组模式, 提示需要加强监测献血人群中HIV毒株的流行情况, 为保障安全用血提供科学数据。

• 单位
  北京市红十字血液中心