生菜EST-SSR的分布特征分析（英文）

作者：张光望; 游杨; 罗延延; 张明菊; 李志良; 王书珍

来源：Agricultural Science & Technology, 2016, 17(12): 2682-2688.

DOI：10.16175/j.cnki.1009-4229.2016.12.002

• 生菜
• 表达序列标签
• 微卫星
• 种质资源

从NCBI数据库下载了81 518条生菜EST序列,处理后得到无冗余序列61 757条,共搜索到2 040个SSR位点,出现频率为3.3%。三碱基重复是主要的类型,占38.53%,其次是二碱基和六碱基重复,出现次数最低的是四碱基重复。在181种重复基元类型中,(AGA)n和(ATG)n是主导的重复基元类型,分别占12.01%和3.53%。设计合成的30对引物在50份生菜资源进行鉴定,共筛选出4个材料特异性标记。该研究为后续开发生菜多态性EST-SSR标记,进行种质资源鉴定、分子标记辅助育种、遗传图谱构建奠定了基础。

• 单位
  生命科学学院; 黄冈师范学院