基于生物信息学探讨中药调节铁死亡干预肝癌的用药规律

作者:姚元谦; 刘英; 杨玉雯; 吕建林*; 黄晶晶
来源:广西大学学报(自然科学版), 2022, 47(01): 235-244.
DOI:10.13624/j.cnki.issn.1001-7445.2022.0235

摘要

为了探讨中药调节铁死亡干预肝癌的化合物及用药规律,通过FerrDb、TCGA数据库及R软件,获取肝癌中铁死亡差异靶点并进行富集分析。以ADME参数和Lipinski规则为过滤条件,利用TCMSP平台筛选可作用于差异靶点的化合物及中药,并构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络。运用中医传承计算平台对用药规律进行分析。借助AutoDock Vina软件将网络中核心化合物与作用靶点进行分子对接,以评估其结合强度。结果表明:共获得84个差异靶点,其中13个靶点可匹配到化合物,共收集到103个候选化合物及277味中药。富集分析得出铁死亡、花生四烯酸代谢、血管内皮生长因子(VEGF)、哺乳动物雷帕霉素靶点蛋白(mTOR)等信号通路。用药规律分析显示,药性以寒、温、平为主,药味以苦、辛、甘味最多,归经则以肝经、肺经、脾胃经、肾经常见,中药功效以清热解毒类、补虚类、活血化瘀类为主。48组分子对接得分均小于-4.25 kcal/mol,平均得分为-8.38 kcal/mol。本次研究系统分析了中药调节铁死亡治疗肝癌的用药规律,并初步分析了铁死亡干预肝癌的作用机制,可为后续中药调节铁死亡的基础研究提供思路。

全文