油用向日葵GDSL脂酶/脂肪酶基因的序列分析

作者:于海峰; 张旭婷; 马艳红; 李美娜; 陈阜*; 李素萍; 郭树春; 张艳芳
来源:中国农业大学学报, 2018, 23(10): 18-28.

摘要

为挖掘油用向日葵中的GDSL脂肪酶基因,本研究以油用向日葵转录组测序得到的Unigenes为对象,筛选GDSL脂酶/脂肪酶基因并对其理化性质和序列结构等特点进行生物信息学分析。结果表明:油用向日葵中筛选到7个GDSL脂酶/脂肪酶基因,编码的蛋白质为稳定存在的亲水性蛋白,由255396个氨基酸组成,分子量介于28.7542.61ku,等电点分布在4.918.89;除unigene 60916外,编码的蛋白质都含有较多的跨膜区域和较高的磷酸化程度;α-螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构;进化树分析表明,这7个基因聚为三类,保守性较高,其中unigene 58624与AT4G01130.1在同一分支上高度保守,unigene 60916与AT1G74460.1相似度最高,含有多个α螺旋和β折叠,推测与种子的油脂代谢有关。