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摘要
TIFY是一类在植物中具有特异性的转录因子，它可以调控植物的生长发育、逆境胁迫响应及植物激素信号网络传导等过程。为了研究柑橘TIFY基因家族成员，并探究它们在不同组织中的表达模式，本研究采用生物信息学方法从克里曼丁橘基因组中共筛选到14个CcTIFY成员，并对其染色体位置、结构特征、聚类分析、启动子、共线性及组织表达特异性进行分析。结果显示，除了6号染色体之外，CcTIFYs基因在1～9号染色体中呈现不均匀分布的情况。通过对柑橘、拟南芥和水稻的演化进行分析，并考虑保守motif和结构域的结构特征，将CcTIFY成员划分为四个亚族，即PPD、TIFY、JAZ和ZML。各亚族内基因相对保守，其所编码的44个蛋白均含有高度保守的TIFY结构域。通过对序列进行分析，发现CcTIFYs基因的启动子中包含了光响应、胁迫响应、激素响应以及植物生长发育相关的顺式作用元件。共线性分析的结果显示，分别有11个和6个柑橘CcTIFY与拟南芥AtTIFY和水稻OsTIFY之间形成15条共线性关系对。通过对克里曼丁橘不同组织部位的转录组数据进行分析，发现14个CcTIFYs在柑橘的叶、果、根和茎中表现出差异表达模式，其中属于JAZ亚族的7个CcTIFYs基因在根部显著性差异表达。本研究为解析克里曼丁橘CcTIFY蛋白的生物学功能提供一定的参考。
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