忍冬属黄酮合成酶基因FNSⅡ密码子偏好性及进化分析

作者：何志敏; 曾子豪; 朱肖霞; 余清婷; 胡珊巍; 满威; 刘素纯

来源：中国中医药信息杂志, 2022, 29(05): 105-111.

DOI：10.19879/j.cnki.1005-5304.202109444

• 忍冬属
• 黄酮合成酶基因
• FNSⅡ
• 密码子偏好性
• 进化分析

目的 探讨忍冬属木犀草苷关键合成酶基因FNSⅡ在进化过程中形成的密码子使用模式及其与不同植物的亲缘关系，为实现木犀草苷异源高表达提供依据。方法 利用Codon W、Clustal X、MEGA4.0及SPSS18.0软件，对23个不同物种的FNSⅡ基因及29条忍冬属FNSⅡ序列进行密码子偏好性和进化分析。结果 植物FNSⅡ的平均有效密码子数(ENC)为52.29，表明该基因密码子偏好性较弱；ENC-Plot分析发现FNSⅡ基因密码子偏好性形成主要受突变压力的影响，但忍冬属FNSⅡ更多受到自然选择压力的影响。忍冬属FNSⅡ序列GC含量均值<50%,GC3s均值在50%左右，ENC均值为52.66，整体密码子偏好性较弱。基于FNSⅡ序列的系统进化聚类分析较相对同义密码子使用度(RSCU)聚类分析更符合传统的物种分类结果。酵母是忍冬FNSⅡ最佳外源表达系统，模式植物拟南芥、烟草均可作为忍冬FNSⅡ的遗传转化受体。结论 忍冬属FNSⅡ序列表现出相似的密码子偏好性，可为忍冬属植物FNSⅡ基因的分类、演化与表达及植物育种研究提供依据。

• 单位
  湖南农业大学; 长沙学院