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摘要
旨在通过测定Prdm9基因锌指域序列，探索四川3个黑绵羊群体间的亲缘关系。采集黑绵羊群体抗凝全血，提取基因组DNA,用PCR特异扩增Prdm9基因锌指域，进一步通过克隆测序以分析遗传多样性。结果显示，黑绵羊中鉴定出存在9种锌指，锌指间存在1～5个氨基酸差异，共构成5种Prdm9锌指域，分别定义为不同的等位基因(A、B、C、D和E),其中A～D包含8个锌指，这是试验黑绵羊Prdm9锌指域的主要类型，E包含9个锌指且仅发现于盐源黑绵羊中，其等位基因频率仅为0.050。这些等位基因形成6种基因型，包括AA、AC、BB、BD、CC和EE,在布拖黑绵羊和普格黑绵羊中均检测到4种基因型，而盐源黑绵羊中有6种，且BB和EE仅在该群体中观察到。Prdm9的等位基因频率和PIC值在3个黑绵羊群体中存在不同程度差异，有较丰富的遗传多态性，其中盐源黑绵羊相对最丰富。3个黑绵羊群体Prdm9锌指域的等位基因频率分布均极显著偏离哈代-温伯格平衡(P<0.01),提示它们在育种中受到较大的人工选择影响。综上所述，黑绵羊群体中Prdm9有较丰富的遗传多样性，3个群体间亲缘关系均较近。
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