鸡MDA5的序列分析与结构域预测

作者：庄海彬; 李伟强; 黄小武; 叶芷羽; 丘林峰; 林宏文; 宋亚婷; 丁仰保; 黄鉴妮^*; 焦培荣^*

来源：中国家禽, 2023, 45(06): 36-42.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2023.06.006

• 鸡黑色素瘤分化相关基因-5
• 基因克隆
• 序列分析
• 结构域预测

为了解鸡黑色素瘤分化相关基因-5(Melanoma differentiation-associated protein 5,MDA5)的序列和结构域，试验使用PCR方法扩增了鸡MDA5基因并构建真核表达质粒，实现了鸡MDA5蛋白的真核表达，同时利用MegAlign等软件对鸡MDA5氨基酸序列进行分析。结果显示：鸡MDA5全长3 006 bp，编码1 001个氨基酸；鸡MDA5与人、猕猴、野猪、小鼠、绿头鸭、灰雁、鸿雁、鲫鱼、草鱼的氨基酸相似性分别为62.4%、62.9%、62.7%、64.1%、86.8%、87.3%、87.4%、48.1%、46.3%；鸡MDA5与鸟类进化关系较近，与哺乳动物次之，与鱼类进化关系较远；鸡MDA5由N端两个半胱天冬酶激活招募结构域、DExD/H box RNA解旋酶结构域和C端结构域组成；鸡MDA5二级结构包含α螺旋（50.95%）、延伸链（11.19%）、β转角（3.9%）和无规则卷曲（33.97%），三级结构与人MDA5类似，在空间上呈现半闭合环状结构。研究成功鉴定了鸡MDA5基因，分析了其基因序列并预测其结构域，为深入研究鸡MDA5结构与功能及其在鸡抗病毒天然免疫应答中的作用奠定基础。

• 单位
  广西大学; 华南农业大学; 广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室