提出"零库存、零等待、零寻找、短物流、高柔性"的制造系统精益设计功能性特点,以其为切入点,采用平衡计分卡方法构建制造系统精益设计评价指标体系,并采用指数标度的层次分析(AHP)方法构造判断矩阵,确定较客观的评价指标权重。然后提出加权校准马氏距离改进的TOPSIS决策方法,对制造系统精益设计方案进行优劣排序。最后应用实例验证所提方法的合理性和有效性,为制造系统精益设计方案决策提供实践参考。