棉铃虫CCE001a蛋白结构与功能的生物信息学分析

作者：张莉; 王海亮; 马雪儿; 牛俊丽; 陈程^*; 张文举^*

来源：安徽农业科学, 2022, 50(01): 102-105.

• CCE001a
• 羧酸酯酶
• 解毒
• 蛋白质修饰位点
• 生物信息

[目的]深入预测CCE001a蛋白结构与生物学功能。[方法]使用生物信息学方法预测CCE001a基因所编码的蛋白质,预测其功能与结构。[结果]该蛋白的总氨基酸残基数为556个,分子式为C2865H4321N737O811S23,蛋白的等电点pI为5.32,带正电的氨基酸残基(Arg+Lys)为58个,带负电的氨基酸残基(Asp+Glu)为75个,蛋白不稳定系数为35.22,脂肪系数为75.91,总平均亲水性系数为-0.262;CCE001a蛋白有一个脱氢酶超家族(cl21494)结构域;经分析显示,α-螺旋、无规律的卷曲是这种蛋白质的主要二次结构,分别占31.35%和46.49%,还包括3.96%的β-转角和18.20%的扩展延伸链。经过三级结构学预测表明,该蛋白包括α-螺旋、β-转角;该蛋白亚细胞被确认为定位在内质网内,存在着信号肽的序列,初步可以认为是具有分泌力的亲水蛋白,且没有出现跨膜蛋白,共有37个磷酸化位点,1个N-糖基化位点。[结论]该研究可为研究CCE001a的解毒机制提供理论基础。

• 单位
  石河子大学; 动物科技学院