全转录组测序在儿童急性B淋巴细胞白血病中的应用

作者：邹品力; 廖欣; 肖剑文^*

来源：中国实验血液学杂志, 2022, 30(06): 1700-1707.

DOI：10.19746/j.cnki.issn1009-2137.2022.06.012

• 急性B淋巴细胞白血病
• 全转录组测序
• 二代测序
• 融合基因
• 儿童

目的:探索儿童急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)的分子遗传学特点及全转录组测序(RNA-seq)在儿童B-ALL中的应用价值。方法:收集并分析2015年5月-2020年4月重庆医科大学附属儿童医院血液肿瘤中心收治的初诊B-ALL患儿的临床及实验室检查资料，所有患儿均经骨髓形态学及组织化学染色、流式细胞术确诊，且完善染色体核型分析、荧光原位杂交(FISH)、逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)及RNA-seq检测。结果:129例初诊B-ALL患儿中男71例，女58例，中位年龄50(8-190)个月，99例患儿检出融合基因阳性，阳性率76.7%,86例检测出白血病相关及可能相关基因突变阳性，阳性率约为66.7%。ETV6-RUNX1、BCR-ABL1、TCF3-PBX1、KMT2A重排检出率在FISH、RT-PCR、RNA-seq中无明显差异，此外RNA-seq检出较多罕见的融合，包括KMT2A-USP2 1例、Ph样相关融合基因4例、MEF2D重排5例、PAX5重排5例、ZNF384重排3例等，以及意义暂不明确或尚未在白血病患儿中报道的融合基因若干。其中ETV6-RUNX1融合基因阳性患儿诱导缓解治疗反应好，BCR-ABL1及ZNF384重排阳性患儿诱导反应差，微小残留病缓解率与其他类型的患儿比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:全转录组测序不仅能检测出已知的融合基因，同时能发现新的及罕见的融合基因及基因突变，其应用对B-ALL患儿危险度分级及精准靶向治疗有重要指导意义。

• 单位
  成都儿童专科医院; 成都市妇女儿童中心医院; 重庆医科大学附属儿童医院