由于复杂的竞争环境，共享资源下的交互系统组织形式变得越来越普遍，因此有必要开发一种新的方法来衡量这些系统与子系统的效率。针对复杂系统的绩效评价问题，本文提出资源共享与子系统交互的两阶段DEA评价方法予以应对。该方法在测定系统总效率的基础上，运用Stackelberg博弈方法构建模型求解出唯一的子系统(阶段)效率。最后，将该方法应用于我国40所“一流大学”科研系统绩效评价中，评价结果反映出一定的科研系统特征，并验证了该方法的有效性。
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