非小细胞肺癌自适应放疗患者血浆外泌体微小RNA差异表达谱和生物信息学分析

作者：杨海华; 周苏娜; 王学全; 夏鑫航; 汤幸妮; 朱远; 封巍

来源：肿瘤学杂志, 2021, 27(09): 728-734.

• 非小细胞肺癌
• 靶基因
• 差异表达谱
• RNA
• 外泌体
• NSCLC
• miRNA
• 生物信息学分析
• 放疗患者

[目的]分析Ⅲ期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)自适应放疗中不同放射敏感性患者的血浆外泌体微小RNA (microRNA,miRNA)差异表达谱,并应用生物信息学分析外泌体miRNA的作用。[方法] NSCLC患者接受自适应放疗20次时的胸部增强CT进行肿瘤评估,划分为放射敏感组与放射抵抗组,从中筛选出5对进行下一步研究。通过QIAseq建库方法构建稳定的miRNA特异文库,并利用Illumina高通量测序技术检测miRNA差异表达谱。对差异miRNA靶基因进行生物信息学分析,分析其涉及的主要生物学功能及信号通路。[结果]与放射敏感患者相比,放射抵抗患者血浆外泌体中共有142个miRNA异常表达,其中下调42个,上调100个。通过基因本体富集及京都基因与基因组百科全书的通路富集分析,上述差异表达miRNA的靶基因功能主要富集于TGF-β、Hedgehog、mTOR、p53等信号通路,涉及RNA聚合酶、泛素样蛋白转移酶等多种细胞生化代谢途径,并参与细胞黏附、细胞周期、衰老等多种生物学过程。[结论]不同放射敏感性NSCLC患者血浆外泌体miRNA表达谱发生了明显变化,可能通过TGF-β等信号通路在NSCLC放射敏感性调控中发挥重要作用。

• 单位
  浙江省肿瘤医院; 温州医科大学; 浙江省台州医院; 中国科学院大学; 浙江中医药大学