达乌尔黄鼠线粒体Cyt b基因序列特征及其系统进化分析

作者：王静; 纪维红; 徐长林; 苏军虎

来源：草原与草坪, 2016, 36(03): 17-22.

DOI：10.13817/j.cnki.cyycp.2016.03.004

• 达乌尔黄鼠
• 线粒体
• 遗传多样性
• Cyt b

在甘肃省天祝藏族自治县采集12只达乌尔黄鼠(Spermophilus dauricus),PCR产物直接测序获得Cyt b基因1140bp序列,采用Clustal X 1.84、MEGA 6.0、Dna SP 5.0等生物信息学软件进行了序列特征和系统地位分析。结果显示,达乌尔黄鼠Cyt b基因含116个多态信息位点,群体中多态位点类型有转换、颠换,Cyt b基因T,C,A,G碱基含量分别为33.7%,25.9%,27.6%,12.9%。基于Kimura双参数的遗传距离显示,属内种间大黄鼠(Spermophilus major)与新疆黄鼠(Spermophilus fulvus)间遗传距离最小(0.034),高加索黄鼠(Spermophilus musicus)与达乌尔黄鼠最大(0.172),达乌尔黄鼠群体内遗传距离为0.140,种群分化较大,基于NJ法构建的系统进化树符合传统分类标准,研究为达乌尔黄鼠Cyt b基因标记的种群遗传学应用提供了参考。

• 单位
  甘肃农业大学; 兰州职业技术学院; 草地农业生态系统国家重点实验室