紫薇F3H基因的克隆与生物信息学分析

作者:陈可欣; 乔中全; 曾慧杰; 李永欣; 蔡能; 陈艺; 王晓明; 何钢*
来源:湖南林业科技, 2021, 48(02): 55-60.

摘要

以"紫韵"紫薇为实验材料,利用cDNA末端快速克隆技术得到紫薇的F3H(LiF3H)基因的全长序列,进行生物信息学分析。结果表明:LiF3H基因的cDNA序列为1372 bp,最大开放阅读框为1116 bp,编码371个蛋白质;其蛋白分子量为41.600 4 KD,等电点为5.26,含依赖Fe2+和2—酮戊二酸的双氧酶超家族结构域,不含信号肽和跨膜结构域,该蛋白是不稳定的亲水性蛋白。系统进化树显示,LiF3H蛋白与石榴F3H蛋白的亲缘关系最近。