白菜HSP90基因家族的鉴定及表达分析

作者：袁凌云; 吴颖; 张利婷; 郑禹杉; 聂立兵; 朱世东; 侯金锋; 陈国户; 唐小燕; 汪承刚

来源：分子植物育种, 2021, 1-12.

• 白菜
• 热激蛋白
• 全基因组鉴定
• 表达分析

本项目为了深入研究白菜（Brassica rapa）热激蛋白90 （heat shock protein 90， HSP90）家族基因在温度胁迫下的响应机理及相关功能，利用生物信息学的方法对白菜HSP90基因家族成员进行了鉴定，同时分析了这些家族成员的理化性质、基因结构、进化关系、染色体分布、启动子元件以及表达模式。结果表明：白菜中至少含有14个HSP90基因，氨基酸长度在490～820之间，呈酸性，分布于10条染色体上，含有1～19个不等的内含子，10个保守基序；基于系统进化树分析，将14个基因分为5个簇；顺式作用元件分析得到7个响应温度胁迫基因；荧光定量分析表明这些基因在温度胁迫下存在显著差异，表明这些基因广泛参与温度胁迫响应。本研究为后续白菜HSP90基因功能挖掘提供一定基础。

• 单位
  安徽农业大学