巴马香猪FABP4基因的克隆及其组织表达分析

作者：谢红月; 潘鹏; 罗云彦; 胡旭旭; 甄锐; 蒋钦杨; 黄艳娜^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2020, (21): 19-24.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2020.02.0164

• 巴马香猪
• FABP4基因
• 克隆
• 组织表达
• 背最长肌
• 生物信息学分析

为了获得巴马香猪脂肪酸结合蛋白4(FABP4)基因的编码区序列(CDS),并探究FABP4基因在巴马香猪不同器官/组织中的mRNA表达水平,试验以巴马香猪背最长肌为材料,提取总RNA并扩增出FABP4基因的CDS,运用在线分析系统进行生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR技术检测巴马香猪心脏、脾脏、肝脏、肾脏、肺脏、背最长肌和胰腺等器官/组织中FABP4基因的mRNA表达水平。结果表明:成功克隆得到巴马香猪FABP4基因的CDS,长度为488bp,与GenBank中公布的猪FABP4基因同源性为99.6%,并且存在2个突变位点,第421位点处G→A为同义突变,第462位点处A→G导致赖氨酸突变为精氨酸;巴马香猪FABP4基因CDS与猪、人、黑猩猩、猕猴、牛和家鼠的同源性分别为99.6%、89.3%、89.3%、88.7%、87.3%和82.8%,且与普通猪的遗传距离最近,聚类为一支;巴马香猪FABP4蛋白氨基酸组成中苏氨酸和缬氨酸含量较高,均占氨基酸总数的10.6%;FABP4蛋白为亲水蛋白,包含一个Lipocalin超家族结构域;巴马香猪FABP4蛋白的二、三级结构包含α-螺旋、延伸链、β-折叠和无规则卷曲;另外,巴马香猪背最长肌FABP4基因的mRNA表达量显著高于其他器官/组织(P<0.05),肾脏中的表达量也较高,胰腺中的表达量最低。说明FABP4基因可作为探究巴马香猪脂肪沉积的主要候选基因之一。

• 单位
  广西大学