长链非编码RNA在新生大鼠缺氧缺血脑组织中的表达

作者：赵凤艳; 屈艺; 李世平; 刘海婷; 张莉; 母得志

来源：中华实用儿科临床杂志, 2016, 31(05): 376-379.

DOI：10.3760/cma.j.issn.2095-428X.2016.05.014

• 长链非编码RNA
• 大鼠,新生
• 缺氧缺血

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)在新生大鼠缺氧缺血性脑损伤中的表达情况。方法 10日龄SD大鼠分为假手术组和缺氧缺血组,于缺氧缺血24 h处死取脑。采用HE染色观察脑组织病理改变,采用芯片技术检测缺氧缺血组和假手术组lncRNA和mRNA的表达,采用实时定量PCR验证芯片数据。对差异表达mRNA进行基因本体论(GO)分析、通路分析和编码-非编码基因共表达网络等生物信息学分析。结果 HE染色显示缺氧缺血组脑组织细胞肿胀、结构不清,排列紊乱。芯片数据表明,与假手术组相比,缺氧缺血组脑组织中322个lncRNA和375个mRNA呈差异表达(P<0.05),实时定量PCR结果与芯片结果一致。GO分析结果表明,上调表达的mRNA主要富集于损伤反应过程,而下调表达的mRNA则主要富集于成体干细胞分裂过程。通路分析结果表明,上调表达的mRNA主要与细胞因子及其受体相互作用通路相关,而下调表达mRNA则主要与轴突导向通路相关。编码-非编码基因共表达网络分析发现,177个lncRNA与炎症、细胞死亡方面的mRNA表达相关(P<0.05)。结论缺氧缺血导致新生鼠脑组织中lncRNA和mRNA显著改变,lncRNA可能通过与mRNA相互作用参与发育期脑缺氧缺血损伤的病理过程。

• 单位
  四川大学华西第二医院