克氏原螯虾多巴脱羧酶的cDNA克隆、序列分析及表达分布

作者:王凯; 沈秀丽; 蔺思函; 杜杰; 于晓东; 郭艳波; 李博; 杜志强*
来源:云南农业大学学报:自然科学版, 2020, 35(02): 243-250.

摘要

【目的】克氏原螯虾(Procambarus clarkii)属于节肢动物门甲壳纲十足目,也称淡水小龙虾。多巴脱羧酶(dopa decarboxylase)作为小龙虾先天免疫应答中的一种关键酶,在抵御外来病原体的侵害上起到了重要作用。本研究以克氏原螯虾为材料,克隆了Pc-ddc cDNA序列并对其进行生物信息学及组织mRNA表达分析。【方法】通过分子生物学技术构建大肠杆菌表达载体,并进行生物信息学分析,同时应用qRT-PCR技术分析其mRNA组织表达分布。【结果】生物信息学分析表明:获得了开放阅读框全长为1 425 bp的Pc-ddc基因的cDNA序列,编码474个氨基酸残基,多肽的理论分子量为52.99 ku,蛋白分子式为C2384H3689N647O674S25,等电点为5.98,为弱酸性蛋白且N-末端无信号肽。亚细胞定位表明:Pc-DDC蛋白在线粒体中最多;组织表达分析表明:Pc-ddc mRNA在检测的6个组织中差异表达,其中,淋巴组织表达量最高。【结论】本研究为克氏原螯虾等无脊椎动物先天免疫系统的深入探索提供了理论支撑。