贵州草海鲫鱼HIF-1α和HIF-2α基因克隆与表达分析

作者：李青; 葛传龙; 欧阳力剑; 金志梅; 杨钦

来源：江苏农业科学, 2022, 50(17): 31-38.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2022.17.006

• 鲫鱼
• HIF1α基因
• HIF2α基因
• 组织表达
• 生物学功能

为研究鲫鱼中HIF不同亚型基因的结构与生物学功能，克隆获得鲫鱼中HIF同源基因的2种亚型，分别命名为Ca-HIF1α和Ca-HIF2α。其中，Ca-HIF1α cDNA全长共3 867 bp,开放阅读框2 322 bp,编码774个氨基酸。Ca-HIF2α cDNA全长共4 647 bp,开放阅读框2 460 bp,编码820个氨基酸。预测蛋白质的分子质量分别为85.844、91.228 ku,等电点分别为5.12和6.20。SMART分析结果可知，二者具有HLH、PAS和PAC结构域，此外，多序列比对结果显示二者还具有ODD、N-TAD和C-TAD功能域。进化树结构表明，Ca-HIF2α比Ca-HIF1α进化得要快。实时荧光定量PCR结果显示，Ca-HIF2α mRNA在所检测组织中的相对表达量均高于Ca-HIF1α mRNA的表达量。此外，Ca-HIF1α和Ca-HIF2α mRNA在肝脏和鳃的相对表达量最高。

• 单位
  贵州工程应用技术学院