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摘要
目的 挖掘软骨损伤和再生相关的mRNA和miRNA生物标志物。方法 分析包含来自同一患者的膝关节受损和未受损样本的基因表达数据集（GSE129147）。借助R语言软件LIMMA筛选差异表达基因（DEG），结合ClusterProfiler进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书功能富集分析。应用Cytoscape插件、CytoHubba和MCODE筛选蛋白质-蛋白质相互作用网络和中枢基因。结果 共鉴定出422个DEG，涉及骨骼系统发育、骨发育、骨化、间充质发育、间充质细胞分化、结缔组织发育、成骨细胞分化和细胞外基质。筛选30个中枢基因，鉴定了3个蛋白质-蛋白质相互作用模块。构建了miRNAs与靶标DEG之间的调控网络。结论 中枢基因与基因本体论之间的关系表明WNT5A和COL1A1可能在软骨损伤中起重要作用。MiRNet预测DEG的miRNAs,miRNA-mRNA网络显示一些重要的miRNAs,miR-335-5p、miR-92a-3p和miR-98-5p可能具有损伤软骨再生或修复的潜能。
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