基于转录组测序方斑东风螺LPS刺激的免疫机制研究

作者：陈宗发; 洪雨洁; 赵明明; 王菁; 王忠良^*

来源：安徽农业科学, 2023, 51(04): 85-91.

• 方斑东方螺
• 转录组
• 脂多糖
• 免疫通路

[目的]进一步挖掘方斑东风螺(Babylonia areolata)免疫系统中参与响应脂多糖刺激的重要功能基因与通路。[方法]采用Illumina HiSeqTM 2000高通量测序平台对不同处理条件的方斑东风螺进行测序分析。所得的原始数据经质控、组装后分别比对到KOG、Nr、Swiss-Prot和KEGG数据库进行功能注释，筛选差异表达基因并进行聚类分析。[结果]GO功能注释结果显示，多数unigenes被注释到代谢过程(metabolic process)、催化活性(catalytic activity)和细胞过程(cellular process)。KEGG注释结果显示，多数差异表达基因集中于代谢通路(Metabolic pathways)(28.3%)、次生代谢物的生物合成(Biosynthesis of secondary metabolites)(8.69%)、核糖体(Ribosome)(7.47%)和内吞作用(Endocytosis)(5.84%)。对比对照组，试验组中LPS刺激后4 h组具有9 096个差异表达基因，8 h组具有10 335个差异表达基因，而4 h组和8 h组间则存在8 756个差异表达基因，通过KEGG数据库对DEGs进行注释和功能富集，关注到的显著通路包括NOD样受体信号通路、趋化因子信号通路等。[结论]暗示脂多糖调节方斑东风螺的抗病能力通过许多通路，是一个复杂的过程，可为进一步研究方斑东风螺的免疫响应机制研究提供理论数据。

• 单位
  广东海洋大学