基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱在幽门螺杆菌鉴定中的应用

作者：陈飞; 杨峰; 张景皓; **; 王诗雯; 张艳梅; 赵虎

来源：中华检验医学杂志, 2017, 40(01): 31-35.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2017.01.007

• 幽门螺杆菌
• 光谱法,质量,基质辅助激光解吸电离

目的优化幽门螺杆菌(H.pylori)基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测前处理方法,建立MALDI-TOF MS的H.pylori超级图谱并验证其鉴定能力。方法收集2015年1月至2016年7月期间复旦大学附属华东医院临床胃活检组织样本469例,进行H.pylori分离培养和鉴定,并利用16 S rRNA测序验证,共获得91株H.pylori菌株用于后续MALDI-TOF MS检测。在进行MALDI-TOF MS检测前,比较50%异丙醇、甲酸乙腈(1:1)以及70%甲酸用于H.pylori前处理的效果。从91株临床分离的H.pylori菌株中随机选取40株进行MALDI-TOF MS检测,再进一步分别随机抽取原始图谱分为5株组、10株组、20株组和30株组,每组重复3次,采用SARAMIS Premium软件分析,建立超级图谱。剩余的51株H.pylori菌株用于验证新建超级图谱的鉴定能力。结果70%甲酸进行前处理效果最好。30株组建立的超级图谱的鉴定率最高,可达90.2%。用于验证的306张质谱图中46.1%的图谱取得了高可信度(≥90%)的鉴定结果、22.2%的图谱取得了中低度可信的鉴定结果,31.7%的图谱无鉴定结果。结论本研究优化了MALDI-TOF MS鉴定H.pylori的前处理方法,并建立了H.pylori超级图谱,提高了MALDI-TOF MS对于H.pylori的鉴定能力,为临床上快速准确地鉴定H.pylori提供了新的检测平台。

• 单位
  华东医院; 复旦大学