基于DNA条形码和SRAP的太子参种质遗传多样性分析

作者：李萍萍; 王泽榕; 王丁; 莫晶晶; 陈美霞; 叶祖云^*

来源：热带作物学报, 2022, 43(10): 2037-2046.

• 太子参
• DNA条形码技术
• SRAP分子标记技术
• 遗传多样性

应用DNA条形码和SRAP分子标记技术，开展15份太子参种质资源遗传差异分析。太子参DNA条形码显示：ITS1序列的突变位点占比最多为2.16%,rbcL6序列的突变位点占比最少为1.23%;psbA-trnH序列缺失位点占比最多为4.88%;ITS1序列的GC含量最高，达55.52%;psbA-trnH序列的GC含量最低，仅为24.71%。太子参SRAP标记筛选出9对引物，扩增出215个位点，其中42个为多态性位点，多态性位点百分率（PPL）为19.53%；从扩增位点总数看，多态性条带丰富、清晰，既有共同位点又有特异性位点；7个居群Nei’s遗传多样性指数（H）范围为0.3466～0.4985,Shannon信息指数（I）范围为0.5301～0.6917，显示出较高的遗传多样性水平，太子参种群基因多样性（Ht）为0.4004，其中种群内基因多样性（Hs）和遗传分化系数（Gst）分别为0.0901、0.3103，分别占Ht的77.50%、22.50%。种源间Gst为0.7506，即有75.06%的遗传变异存在于种源间，24.94%的遗传变异存在于种源内，表明太子参种源间遗传变异大于种源内遗传变异，存在较低程度的遗传分化。太子参种源的平均基因流（Nm）为0.1929，表明太子参各种源之间的基因交流顺利。15份太子参种质间的K2P遗传距离范围为0.0005～0.0056，而遗传相似系数在0.3913～0.8695之间，遗传相似系数在0.5900时，可将15份种质分为3个类群，其中杂交种质为独立类型。15份不同种质太子参DNA条形码和SRAP分子标记的遗传距离、遗传相似系数及聚类分析结果相近，以这2种方法相结合，能更准确有效鉴定太子参种质，这对太子参种质资源的利用及杂交新品种的选育具有重要意义。

• 单位
  福建农林大学; 生命科学学院; 宁德师范学院