犬圆环病毒全基因组克隆与序列分析

作者：孙文超; 曹慧慧; 郑敏; 徐素萍; 张红云; 韦显凯; 苏姣秀; 何杰勇

来源：病毒学报, 2016, (04): 429-435.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.002982

• 犬圆环病毒
• 基因
• 进化分析 Dog circovirus
• Genome
• Phylogenetic analysis

犬圆环病毒(Dog circovirus,DogCV)是近年来新发现的一种哺乳动物圆环病毒。为研究DogCV中国流行毒株基因组特性和遗传进化,以犬血清样品提取的DNA为模板,采用重叠PCR技术首次获得DogCV中国流行毒株的全基因组序列,命名为JZ98/2014。序列分析表明JZ98/2014全基因组长度为2063nt,编码3个主要开放阅读框:ORF V1(Rep蛋白,303个氨基酸)、ORF C1(Cap蛋白,270个氨基酸)和ORF C2(106个氨基酸)。同源性比较显示JZ98/2014与美国、欧洲流行毒株的全基因组序列同源性为82.1%-89.5%,而Rep和Cap基因同源性分别为82...

• 单位
  广西壮族自治区动物疫病预防控制中心; 广西大学; 玉林市动物疫病预防控制中心