猪圆环病毒2型CAP蛋白B细胞表位预测与分析

作者:吴胜昔; 曾政; 蔡家利; 任康康; 王远强; 梁望旺; 蔺露; 吴玉章
来源:中国兽医杂志, 2014, 50(01): 3-49.

摘要

基于PCV2 CAP蛋白的氨基酸序列,采用Kyte-Doolittle的亲水性方案、Emini方案、Karplus方案Jameson-wolf抗原指数方案,辅以对PCV2 CAP蛋白的二级结构柔性区域分析,并结合吴玉章氨基酸抗原指数计算方法预测CAP蛋白的B细胞表位。结果表明,最有可能的B细胞优势表位位于CAP蛋白N端第418,2328,3241,5764,96103,175182区段和第224233区段。本研究用多参数预测PCV2 CAP蛋白的B细胞表位,为多肽疫苗的设计提供理论依据。