北京地区呼吸道合胞病毒分离株F蛋白基因序列分析

作者：芦起; 申昆玲; 张燕; 刘亚谊; 赵宇红; 刘春艳; 姬奕新; 谢正德; 许文波

来源：首都医科大学学报, 2005, 26(05): 565-567.

DOI：10.3969/j.issn.1006-7795.2005.05.013

• 呼吸道合胞病毒
• F蛋白
• 核苷酸序列

目的分析中国北京地区4株呼吸道合胞病毒(RSV)F蛋白的基因序列并与RSV原型株A2进行比较,得出中国北京地区RSV F蛋白基因是否存在变异及变异特征。方法用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分2段扩增F蛋白的基因核苷酸序列,将得到的P1、P22段切胶纯化标记后测序,应用Bioedit软件对得到的序列做碱基配对和比较分析。结果4株RSV F蛋白核苷酸序列的同源性为94.92%~95.62%。信号肽区的同源性为99.36%~99.73%。F1、F2亚单位同源性分别为98.93%~99.31%和96.69%~97.33%。氨基酸同源性分别为:F蛋白的蛋白编码区97.39%~97.74%,信号肽区99.13%~99.65%,F1、F2亚单位98.78%~99.48%、98.61%~99.30%。结论中国RSV北京株与原型株A2之间的F蛋白基因变异小,具有很高的同源性。氨基酸在抗原位点Ⅱ保守,此段氨基酸可作为RSV疫苗的候选位点。

• 单位
  首都医科大学附属北京儿童医院; 中国疾病预防控制中心