基于TCGA数据集分析CDCA5在肺腺癌中的临床意义与分子机制

作者：王萍; 黄奔; 范维; 柳家翠; 程庆元; 段怡萍; 陈梁玥; 马甜甜; 喻明霞^*

来源：分子诊断与治疗杂志, 2020, 12(12): 1616-1620.

• CDCA5
• TCGA
• 肺腺癌
• 预后因子
• GSEA

目的研究细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)在肺腺癌中的表达、临床意义和分子作用机制。方法在癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肺腺癌RNA测序数据和患者的临床资料,使用R 3.6.1软件提取并分析CDCA5在肺腺癌组织和正常肺组织中的表达量,探究CDCA5表达与患者临床病理特征的联系。结合患者的生存资料,利用cox回归分析CDCA5在肺腺癌患者中的预后作用。使用基因集富集分析(GSEA)探索CDCA5在肺腺癌中的分子作用机制。结果在TCGA肺腺癌数据集(TCGA-LUAD)中,CDCA5在肺腺癌组织中的表达水平显著高于正常肺组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。高表达的CDCA5与肺腺癌患者的TNM分期(P=0.003)和淋巴结浸润(P=0.016)显著相关。多因素cox回归分析显示,CDCA5可以作为肺腺癌的独立预后指标(HR=1.28,95%CI:1.06～1.54,P=0.010)。GSEA分析结果表明,高表达的CDCA5主要参与细胞周期、DNA复制、错配修复、同源重组、RNA降解以及P53信号通路等。结论 CDCA5在肺腺癌组织中表达明显上调,并且与肺腺癌患者的恶性进展特征相关,CDCA5可作为预测肺腺癌预后的新型分子标志物。

• 单位
  武汉大学中南医院