进口冷链产品导致的一起新冠病毒Omicron BA.2暴发疫情传播链及基因序列分析

作者：**; 刘祥亮; 季圣翔^*

来源：预防医学论坛, 2023, 29(02): 137-145.

DOI：10.16406/j.pmt.issn.1672-9153.2023.2.012

• 新型冠状病毒
• 奥密克戎
• 冷链
• 无症状感染者
• 全基因组测序

目的 对2022年山东省临沂市一起进口冷链产品引起的新型冠状病毒Omicron BA.2暴发疫情进行溯源及基因序列分析。方法 对2022年4月3-18日山东省临沂市一起由进口冷链导致的新型冠状病毒肺炎(以下简称新冠肺炎)暴发疫情，收集感染者(Case1～18)信息及Z冷库中产品外包装及环境拭子(Env1～11)、Z冷库环境样本(Env12～14),对此次疫情暴发进行流行病学调查，对采集到的样本进行实时荧光定量PCR检测和全基因组序列测定，使用CLC Genomics workbench 21 Properties软件对测序数据处理分析。结果 该起疫情持续5 d,共有18人感染，均为无症状感染者。ORFlab基因和N基因Ct值的中位数M(P25,P75)分别为27.89(23.87,35.07)、27.46(24.11,35.82)。13条无症状感染者和4份冷链产品样本的全基因组序列共享69～70个核苷酸突变位点和51个氨基酸突变位点。结论 本起疫情为进口冷链产品被新型冠状病毒Omicron BA.2污染引起，主要通过Z冷库和家庭密切接触传播。