近交系小型猪线粒体基因组分析和家猪系统进化关系分析

作者：高也凡; 陈笑寒; 邹辉; 郭亚芬; 黄艳娜; 蒋钦杨^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, 40(02): 531-540.

DOI：10.13417/j.gab.040.000531

• 广西巴马小型猪近交系
• 线粒体基因组
• 系统进化

广西巴马小型猪是长期近交培育而成的实验小型猪,遗传稳定。本研究拟通过线粒体基因组(mitochondrial DNA, mtDNA)分析来了解近交系的遗传背景,并从mtDNA角度进一步认识中国本土猪种的系统进化关系。实验设计29对特异性引物,PCR扩增和产物测序,拼接出广西巴马小型猪近交系7个世代猪的mtDNA序列;用42个品种猪的mtDNA D-loop区和基因编码区序列分布构建系统进化树。结果表明,广西巴马小型猪的mtDNA大小为16 761 bp,碱基组成、基因结构与其他猪种相似;近交系7个世代个体mtDNA发现有46个碱基差异位点,变异率为0.28%,mtDNA序列同源性在99.9%以上,表明该近交系母源单一;基于mtDNA序列构建的系统进化树不能清晰地区分地方品种猪之间的遗传关系。研究结果进一步表明广西巴马小型猪近交系的遗传背景单一,中国本土品种猪的母系关系复杂。

• 单位
  广西大学