基于SSR标记的海南54份榴莲种质资源遗传多样性和群体结构分析

作者：邓会栋; 乔阳; 郭利军; 华敏; 谢圣华; 冀晓昊; 吴晓慧; 冯学杰^*; 王海波^*

来源：中国果树, 2023, (12): 90-2.

DOI：10.16626/j.cnki.issn1000-8047.2023.12.015

• 榴莲种质资源
• 荧光SSR标记
• 聚类分析
• 群体结构
• 遗传多样性
• 遗传分化

对海南省引种种植的54份榴莲种质资源采用荧光SSR分子标记技术，进行SSR多态性分析、聚类分析、群体结构分析、遗传多样性分析。结果表明，筛选获得19对多态性较高的SSR引物，通过DNA扩增共检测出117个多态性等位基因，平均多态性等位基因数为6.158个，平均有效等位基因数为3.398个，香农指数平均值为1.372，观察杂合度和期望杂合度的平均值均为0.689，多态信息指数平均值为0.643，表明具有一定的遗传多样性。基于UPGMA方法进行聚类分析，在遗传距离0.6处54份榴莲种质资源可以分成3个类群，第一类群共45份种质资源，包括引种于不同国家的不同榴莲品种；第二类群共8份种质资源，均为引种于不同国家的猫山王榴莲；第三类群共1份种质资源，是引种于泰国的红榴莲。以遗传距离0.3为阈值，第一类群又可以分为9个亚群。基于Structure可以将54份榴莲种质资源划分为5个亚群。综合聚类和群体结构分析，明确了部分未知种质资源的品种所属，对不同亚群的遗传变异、遗传距离和遗传分化分析发现，个体的变异是总变异的主要来源，亚群5与其他亚群的遗传距离和遗传分化程度最大，不同亚群整体基因流较大，遗传分化程度较低。

• 单位
  海南省农业科学院热带果树研究所; 中国农业科学院果树研究所