膝关节OA关键基因及软骨组织免疫细胞浸润的生物信息学分析

作者:翟港港; 梁夏铭; 岳颂凯; 江晨阳; 董永辉; 郑稼*
来源:中南医学科学杂志, 2023, 51(02): 166-182.
DOI:10.15972/j.cnki.43-1509/r.2023.02.003

摘要

目的 基于生物信息学筛选膝关节骨关节炎(OA)的关键基因、信号通路,并分析软骨组织免疫细胞浸润情况。方法 从GEO数据库中下载来自正常人和OA患者的基因数据集,进行差异表达基因筛选,基因本体论、京都基因和基因组百科全书分析,构建蛋白互作网络,并对软骨相关数据集进行免疫细胞浸润分析。结果 筛选出与OA相关的12个关键基因及86条关键信号通路。免疫浸润结果显示,OA软骨组织与正常软骨比较,其活化CD8T记忆细胞、CD56+NK细胞、髓系来源抑制性细胞、1型辅助型T细胞4种免疫细胞含量差异有统计学意义(P<0.05)。结论 筛选出12个关键基因和4种免疫细胞,其可能参与了OA的进展。

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