罗氏沼虾Rab11基因cDNA克隆及其组织表达分析

作者：夏正龙; 黄雪娜; 黄振远; 陈雪峰; 高强; 濮剑威; 慎佩晶; 彭菲; 杨国梁

来源：水生生物学报, 2016, 40(03): 443-450.

• 罗氏沼虾
• Rab11
• 组织表达
• 免疫应答

为了发掘罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)免疫相关基因,研究Rab蛋白(Ras-related proteins in brain)在罗氏沼虾免疫应答中发挥的作用,研究采用RACE-PCR技术克隆了罗氏沼虾Rab11基因全长c DNA序列,记为Mr Rab11。全长1381 bp,包括226 bp的5′UTR,511 bp的3′UTR和645 bp的开放阅读框,编码214个氨基酸,含有一个Rab结构域。氨基酸序列比对显示,罗氏沼虾与冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)、蚤状溞(Daphnia pulex)、叶蝉(Homalodisca vitripennis)Rab11一致性分别为82%、83%和82%。软件预测,Mr Rab11编码的蛋白分子量约为23.75 k D,等电点约为5.34。实时荧光定量表达分析表明,Mr Rab11基因在罗氏沼虾各组织中都有表达,肝胰腺中的表达量最高,其次是肌肉和肠道。在阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)感染12h后,罗氏沼虾肝胰腺中Mr Rab11的表达量上升,显著高于对照组(P<0.05),推测这是Mr Rab11对阴沟肠杆菌的应激表达,Mr Rab11在肝胰腺中参与了罗氏沼虾免疫应答过程。

• 单位
  浙江省淡水水产研究所