基于雌雄花序表达谱测序的板栗SSR标记开发及其应用

作者：邱文明; 徐育海; 何秀娟; 仝铸; 肖翠; 张娜; 孙中海^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(15): 5046-5053.

DOI：10.13271/j.mpb.018.005046

• 板栗
• 表达谱测序
• SSR
• 毛细管电泳

本研究基于板栗雌雄花差异表达谱数据库,筛选鉴定到雌雄花特异表达基因,在雌雄花特异表达基因中识别和定位了19个SSR位点。通过在SSR两端设计特异引物,经过PCR扩增,筛选到5对多态性和稳定性较好的引物。进一步采用毛细管电泳检测技术对17份板栗资源进行亲缘关系分析。结果显示17个品种可分为3大类,其中第Ⅰ类群包含‘超短枝1号’、‘超短枝2号’、‘沂蒙短枝’、‘燕红’等6个品种,主要为北方板栗品种;第Ⅱ类群中包含10份资源,主要为包括湖北地方品种在内的南方板栗品种;第Ⅲ类仅包括‘金栗王’,与前两大类亲缘关系明显较远。本研究开发的SSR分子标记重复性和多态性较高,可用于板栗资源遗传多样性分析,并为开发板栗雌雄花特异分子标记提供科学依据。

• 单位
  湖北省农业科学院果树茶叶研究所