苹果属种质TP-M13-SSR亲缘关系及遗传多样性分析

作者：侯丽媛; 董艳辉; 聂园军; 邓舒; 肖蓉; 张春芬; 李亚莉; 赵菁; 王育川; 曹秋芬^*

来源：山西农业科学, 2020, 48(09): 1371-1522.

• 苹果属
• 种质资源
• 指纹图谱
• 亲缘关系
• 遗传多样性

利用TP-M13-SSR技术对供试材料进行指纹图谱构建,在此基础上采用GenAlEx 6.501软件对供试材料进行亲缘关系和遗传多样性分析,利用Ntsys软件基于Jaccard系数进行了UPGMA聚类分析。结果显示,16对TP-M13-SSR引物共检测到180个等位基因位点,每个SSR位点检测到的等位基因数从3个(BGT23b、KA4b)到21个(CH01f07a)不等,扩增片段长度大小范围主要在104～245 bp,平均等位基因数为11.25个;有效等位基因数从1.129个(BGT23b)到10.776个(CH04g07),平均有效等位基因数为5.38个;观测杂合度从BGT23b的0.040到CH04g07的0.096,平均值为0.741,期望杂合度值从BGT23b的0.114到CH01f07a的0.907,平均值为0.742,无偏杂合度期望值从BGT23b的0.117到CH01f07a的0.926,平均值为0.758;Shannon’s指数平均为1.827;固定指数平均为0.036。TP-M13-SSR分析结果与已知苹果属间的谱系较为一致。

• 单位
  经济管理学院; 山西省农业科学院农业资源与经济研究所; 生命科学学院; 山西农业大学