2011年猪流行性腹泻病毒的遗传变异分析

作者：刘孝珍; 陈建飞; 时洪艳; 张鑫; 石达; 刘胜旺; 冯力

来源：中国预防兽医学报, 2012, (03): 180-183.

• 猪流行性腹泻病毒
• 遗传变异
• S1基因 porcine epidemic diarrhea virus
• genetic variation
• S1 gene

为分析猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究设计合成2对扩增S1基因的引物,利用套式RT-PCR方法,对2011年分离的17个PEDV S1基因进行扩增、克隆和序列测定;并将其进行比对和遗传演化分析。结果表明:17个PEDV S1基因序列与参考病毒株S1基因核苷酸序列同源性为90.54%～99.96%,与经典病毒株CV777相比,其中有6个S1基因在453 bp～454 bp处存在3个核苷酸的缺失;一个在453 bp～454 bp处缺失6个核苷酸;其它10个S1基因在173 bp～186 bp之间存在12个核苷酸的插入,413 bp～417 bp之间有3个核苷酸的插入,467 bp...

• 单位
  生命科学学院; 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所; 兽医生物技术国家重点实验室; 东北农业大学