盐胁迫下水稻体内miRNA表达谱分析

作者：张秀妍; 徐妙云; 郑红艳; 邹俊杰; 张笑宇^*; 王磊^*

来源：中国农业科技导报, 2020, 22(12): 10-19.

DOI：10.13304/j.nykjdb.2019.0287

• miRNA
• 表达谱
• 盐胁迫
• 水稻

miRNA是生物体内起重要调控作用的一类非编码小RNA分子,在转录后水平调控基因表达,参与生长发育、抗逆等生物学过程。高通量测序法是鉴定植物中miRNA最有效的方法之一。提取盐胁迫处理不同时间的水稻根、茎和叶部的总RNA,从中分离18～30 nt小分子RNA构建文库,进行高通量测序,对miRNA表达谱特性进行了分析。结果表明,所有样品共检测到248个已知的miRNA,来源于132个不同的家族,根、茎、叶中分别有31、11、9个差异表达miRNA,分属于29个家族,靶向592个功能基因,并对其中5个差异显著且与非生物胁迫相关的重要miRNA进行了qPCR分析检测,结果显示Osa-miR166h、Osa-miR166k上调表达,Osa-miR169h、Osa-miR530下调表达,针对Osa-miR169h的4个靶基因进一步定量检测,其中的3个靶基因上调表达,这与Osa-miR169h的下调表达结果相一致,以上结果说明miRNA在植物抵御非生物逆境胁迫的过程中扮演重要角色。

• 单位
  园艺与植物保护学院; 中国农业科学院生物技术研究所; 内蒙古农业大学