高粱花叶病毒广西甘蔗分离物全基因组序列分析

作者：周龙武; 徐正银; 唐瑶; 吕榜丽; 李建勇; 司慧娟; 温荣辉; 陈保善

来源：基因组学与应用生物学, 2014, 33(05): 953-960.

DOI：10.13417/j.gab.033.000953

• 高粱花叶病毒
• 全基因组
• 序列分析
• pipo基因

近年来,高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus,SrMV)已成为危害广西甘蔗的主要病原病毒,但尚未见侵染本地区甘蔗的SrMV全基因组序列的报道。本研究以田间一株感染SrMV的甘蔗为材料,提取叶片总RNA通过RT-PCR及RACE技术扩增获得9 626 nt(不包括polyA尾)的病毒全长基因组序列,命名为SrMV-GX。序列分析表明,SrMV-GX与浙江萧山分离物(SrMV-XoS)、浙江余杭分离物(SrMV-YH)和美国德克萨斯州分离物(SrMV-H)的核苷酸同源性分别为95.4%、94.7%和80.9%编码的多聚蛋白氨基酸同源性分别为97.8%、98.4%和90.4%。与马铃薯Y病毒科的其它成员一样,SrMV-GX基因组中存在一个小的ORF(pretty interesting potyviridae ORF,pipo),且其序列非常保守。本研究对SrMV-GX进行序列分析,为进一步研究SrMV的遗传多样性,改进现有的检测方法及培育健康脱毒甘蔗种苗提供理论依据。

• 单位
  亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室; 广西大学