基于网络药理学及分子对接技术研究黄芪调控仔猪肠道菌群失调性腹泻的作用

作者：孙悦龙; 张梦洁; 豆佳红; 王小莹; 戴小枫^*; 李秀梅^*

来源：中国畜牧兽医, 2022, 49(08): 3200-3211.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.08.036

• 黄芪
• 菌群失调性腹泻
• 网络药理学
• 分子对接
• 有效活性成分
• 作用机制

【目的】基于网络药理学及分子对接技术研究黄芪调控仔猪肠道菌群失调性腹泻的有效活性成分及其作用机制。【方法】从TCMSP数据库搜集黄芪中药化合物成分，并获取其潜在靶点。利用GeneCards和OMIM数据库搜集肠道菌群失调性腹泻(flora imbalance diarrhea)的作用靶点，将两者预测的潜在作用靶点进行映射，获得共同作用靶点。运用STRING数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)关系，用Cytoscape＿3.8.0软件对其网络进行拓扑分析，用DAVID数据库对共同作用靶点进行富集分析，用AutoDuck＿4.2.6软件对其核心成分与核心靶点进行分子对接。【结果】黄芪含有11个调控仔猪肠道菌群失调性腹泻核心成分，其对应靶点基因65个，疾病靶点854个，交集靶点25个。PPI网络中显示肿瘤坏死因子(TNF)、转录因子AP-1(JUN)、半胱氨酸蛋白酶-3(CASP3)、白细胞介素-6(IL6)、NF-κB抑制剂α(NFKBIA)、IL1B、IL10、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、C-C基序趋化因子2(CCL2)为关键靶点。GO功能和KEGG通路富集分析发现，黄芪有效成分主要通过美国锥虫病、炎症性肠病、阿米巴病、细胞因子-细胞因子受体相互作用、A型流感、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路参与转录调控、免疫反应、细胞对脂多糖的反应等生物过程。分子对接结果显示，槲皮素、山奈酚、芒柄花素等核心成分与TNF、IL1B等关键靶点结合紧密，亲和力较好。【结论】黄芪可能通过槲皮素、山奈酚、芒柄花素等主要活性成分作用于TNF、IL1B等靶点，通过参与美国锥虫病、炎症性肠病、疟疾、T细胞受体信号通路、沙门菌感染等信号通路进而治疗仔猪肠道菌群失调性腹泻。

• 单位
  中国农业科学院饲料研究所; 生物工程学院; 天津科技大学