低级胶质瘤候选靶标及预后标志物SLC4A家族的生物信息学分析

作者：刘红云; 张金峰; 莫黎怡; 李国庆; 孟莉娟^*

来源：中南医学科学杂志, 2023, 51(04): 492-496.

DOI：10.15972/j.cnki.43-1509/r.2023.04.005

• LGG
• 预后标志物
• SLC4A家族
• 生物信息学分析

目的 采用生物信息学分析，筛选SLC4A基因家族中可作为低级胶质瘤(LGG)的候选靶标及预后标志物的基因。方法 利用TCGA、GTEx、UCSCXENA、GEPIA、cBioPortal、GeneMANIA、String等数据库，分析LGG患者SLC4A的差异表达、预后价值、遗传改变和蛋白互作等，根据数据筛选SLC4A基因家族中可作为LGG候选靶标及预后标志物的基因。结果 LGG组织中SLC4A2、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A8表达升高，而SLC4A1、SLC4A3、SLC4A9、SLC4A10表达降低。SLC4A2、SLC4A3、SLC4A4、SLC4A7、SLC4A10在LGG肿瘤分级中表达存在显著差异。预后价值总生存率的分析发现，高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8和低表达SLC4A5、SLC4A10的患者预后较差；无病生存率的分析发现，高表达SLC4A2、SLC4A3、SLC4A8和低表达SLC4A10的患者预后较差。结论 SLC4A2、SLC4A3、SLC4A7、SLC4A8、SLC4A10可能是LGG潜在候选靶标及预后标志物。

• 单位
  南华大学; 基础医学院