应用基因微阵列技术筛选法乐四联症相关基因

作者:廖晓波; 周新民; 杨一峰; 杨进福; 李建明; 刘立明; 吴忠仕; 赵天力; 周文武; 胡冬煦
来源:中国循环杂志, 2008, 23(02): 147-150.

摘要

目的:观察法乐四联症(TOF)相关基因的表达变化。方法:使用Biostar 80s型人类基因表达谱微阵列初步筛选TOF和室间隔缺损患者右心室心肌的差异表达基因。结合初筛实验、网上孟德尔人类遗传数据库及心脏基因表达数据库的查询结果,遴选补充至500条目标基因。应用3张定制的1000点人类基因微阵列,双重点样,分别筛选TOF(组)25例、不伴有先天心脏畸形的引产胎儿(FETAL组)5例、右室双出口(组)5例、室间隔缺损(组)15例患者,检测右心室流出道肌肉中的差异表达基因,进行生物信息学分析。采用实时荧光定量聚合酶链反应技术验证微阵列结果。结果:用Biostar 80s微阵列发现186条差异表达基因,用定制微阵列则分别发现104条(TOF/FETAL)、13条(TOF/右室双出口)和315条(TOF/室间隔缺损)。剔除结果可能不可靠者(179条),根据差异表达特征,将剩余基因归入14个相关基因群。实时荧光定量聚合酶链反应证实,胰岛素样生长因子结合蛋白3、Ⅰ型胶原α2链蛋白与Ⅲ型胶原α1链蛋白3个基因的差异表达与微阵列结果相一致。结论:应用基因微阵列技术进行高通量并行分析,可确定与TOF相关的基因表达谱。胶原家族成员及胰岛素样生长因子结合蛋白3可能与TOF的发生发展过程密切相关。