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摘要
单核苷酸多态性(SNP)是生物遗传多态性的一种类型,在各种生物中普遍存在。由于单核苷酸变异可以发生在基因组几乎任何位点上,SNP位点数量巨大且分布极为广泛,成为SNP研究的一大难点。然而,随着生物信息学的蓬勃发展,对于SNP研究已不再像当初一样困难,这样的突破使SNP越来越受到科学家的重视。由于SNP数据量大,分析繁杂,使用统计分析软件R语言分析SNP无疑是一种极为高效的方法。本文介绍了如何利用R语言分析SNP数据,以及如何利用曼哈顿图、连锁不平衡热图和火山图来实现SNPs的可视化,并给出了编程代码。
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单位东北农业大学; 生命科学学院
