裂殖壶藻SlMYB118基因的克隆及生物信息学分析

作者:陈菁; 苏永昌; 孙化淼; 陈由强; 薛婷*; 代容春*
来源:渔业研究, 2023, 45(03): 222-232.
DOI:10.14012/j.cnki.fjsc.2023.03.002

摘要

裂殖壶藻是一种含有丰富DHA的海洋微藻。本课题组前期发现裂殖壶藻的SlMYB118基因与脂肪酸的合成密切相关,是潜在的DHA合成调控的转录因子。本文通过PCR的方法克隆裂殖壶藻的SlMYB118基因的cDNA全长序列,运用生物信息学的方法对其分析。结果预测SlMYB118蛋白质的等电点为8.75,分子量为84.81 kDa,定位于细胞核,且其具有106个潜在的磷酸化位点。SlMYB118基因的结合位点是探索转录调控机制、建立DHA合成相关转录调控网络的关键,本研究为后续确定其结合位点奠定了理论基础。

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