课程思政是完成立德树人、铸魂育人根本任务的重要举措,工程教育专业认证则是提升工科教育水平,促进人才培养与产业需求相适应的重要手段。基于工程教育专业认证和课程思政两方面的背景以及有机化学课程在制药工程专业中的地位和作用,分析了融合工程教育专业认证和课程思政开展有机化学课程改革的必要性,并总结了本专业有机化学课程的工程能力培养和思政素养提升的改革措施。