基于生物信息学方法的精神分裂症炎症机制研究

作者：田海佳; 刘洪杨^*

来源：临床精神医学杂志, 2021, 31(01): 27-30.

• 精神分裂症
• GEO数据库
• 生物信息
• 差异表达基因
• 炎症

目的:通过生物信息学方法研究精神分裂症涉及的炎症机制。方法:从GEO数据库中获取GSE12679基因芯片中11例精神分裂症患者和5名健康对照者背外侧前额叶皮质(DLPFC)内皮细胞转录数据,并通过生物信息学方法找出差异表达基因,通过DAVID在线数据库的基因本体(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析模块找出差异表达基因富集的功能和通路。结果:在精神分裂症患者与正常对照的DLPFC内皮细胞找到389个差异表达基因,其中145个基因表达上调,244个基因表达下调;以P<0.05为标准,找到差异表达基因富集于65个GO条目以及17条KEGG通路,富集的GO条目以及KEGG通路均有涉及免疫机制,包括趋化因子、肿瘤坏死因子信号通路以及Toll样蛋白信号通路等。结论:精神分裂症的病理生理过程或许涉及炎症机制。

• 单位
  温州医科大学; 康宁医院