目的探究核磁共振在脑静脉窦血栓患者诊断中的应用效果。方法将我院2018年2月至2019年2月收治的脑静脉窦血栓患者中随机抽取的40例作为研究对象,随机分两组,对照组使用CT进行影像学检查,研究组使用核磁共振进行影像学检查,对比两组患者检查准确率以及影像学特征。结果研究组患者检查准确率(95%)明显高于对照组(70%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论核磁共振在脑静脉窦血栓患者诊断中的应用效果明显好于传统CT检查,能够清晰显示患者静脉状况,为临床诊断提供参照标准,值得推广应用。